El Consejo está conformado por siete miembros propietarios y tres suplentes que han de ser:

• El Ministro de Educación Pública, quien lo preside.
• Dos exministros de Educación Pública, designados por el Poder Ejecutivo.
• Un integrante nombrado por el Consejo Universitario de la Universidad de Costa Rica.
• Un representante de III ciclo de la Educación General Básica y de la Educación Diversificada, nombrado por los directores de los centros educativos de estos ciclos.
• Un representante de I y II ciclos de la Educación General Básica y preescolar, nombrado por los directores regionales, supervisores y directores de las escuelas de I y II ciclos de la Educación General Básica del país.
• Un integrante designado por las organizaciones de educadores inscritas conforme a la ley, nombrado por sus correspondientes directivas.
   

Actualmente el Consejo Superior de Educación está integrado por las siguientes personas:

• Sra. Anna Katharina Müller Castro, Ministra de Educación Pública y Presidenta del Consejo Superior de Educación
• Sra. Astrid Fischel Volio, Ex Ministra de Educación Pública, Miembro propietario.
• Sr. Manual Antonio Bolaños Salas, Ex Ministro de Educación Pública, Miembro propietario.
• Sr. Jorge Murillo Medrano. Representante de la Universidad de Costa Rica. Miembro propietario.
• Sr. Gabriel Chaves Sánchez, Representante de Educación Primaria, Miembro propietario.
• Sra. Yirlany Vanessa Araya Varela, Representante de Educación Primaria, Miembro suplente.
• Sra. Jacqueline Eunice Badilla Jara, Representante de Educación Secundaria, Miembro propietario.
• Sr. Javier Cascante Granados, Representante de Educación Secundaria, Miembro suplente.
• Sr. Johnny Jesús Varela Elizondo, Representante de las organizaciones de educadores inscritas conforme la ley, Miembro propietario.
• Sra. María Esther Camacho Vargas, Representante de las organizaciones de educadores inscritas conforme la ley, Miembro suplente.
• Sr. Rodolfo Hernández Valerio, Dirección Ejecutiva, Secretaría General.